O CNRLI foi o terceiro Centro exclusivo a abrir na Península Ibérica em Outubro de 2009 no âmbito do programa de conservação ex situ tendo sido transferidos para as suas instalações 16 linces. Foram feitos esforços no sentido de dotar o CNRLI de todo o equipamento necessário para a recepção e manutenção dos animais e formada uma equipa específica para o Centro de veterinários, biólogo e tratadores.

São realizadas trocas anuais de alguns animais, entre os vários centros, de acordo com uma gestão conjunta da população em cativeiro a nível ibérico maximizando a variabilidade genética da espécie.

No seguimento de um Acordo assinado entre os Ministros de Ambiente de Portugal e Espanha foi constituída uma Comissão Mista com representação de ambos os países e em cujas reuniões são discutidas questões relativas às medidas de conservação ex situ e in situ da espécie na Península Ibérica.